Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn2O08529 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Capn2O08529 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn2O08529 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn2O08529 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn2O08529 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn2O08529 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Capn2O08529 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn2O08529 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn2O08529 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn2O08529 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.7 ms