Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933406M09RikG3XA12 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933406M09RikG3XA12 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933406M09RikG3XA12 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933406M09RikG3XA12 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms