Protein–RNA interactions for Protein: F6R5P4

Ccl17, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl17F6R5P4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccl17F6R5P4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl17F6R5P4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccl17F6R5P4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccl17F6R5P4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms