Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtproE9Q612 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtproE9Q612 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtproE9Q612 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtproE9Q612 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms