Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930579F01RikE9Q3L6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930579F01RikE9Q3L6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930579F01RikE9Q3L6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
4930579F01RikE9Q3L6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4930579F01RikE9Q3L6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
4930579F01RikE9Q3L6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930579F01RikE9Q3L6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930579F01RikE9Q3L6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms