Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
5430401F13RikE9Q328 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
5430401F13RikE9Q328 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
5430401F13RikE9Q328 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms