Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20,56■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20,56■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20,55■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,54■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20,53■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20,53■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Cfap46E9Q2C0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20,51■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20,48■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Cfap46E9Q2C0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20,45■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20,45■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20,44■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20,43■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20,43■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Cfap46E9Q2C0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms