Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Sfta2E9PXB6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sfta2E9PXB6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Sfta2E9PXB6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms