Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lonrf1D3YY23 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lonrf1D3YY23 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lonrf1D3YY23 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lonrf1D3YY23 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms