Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pnldc1B2RXZ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pnldc1B2RXZ1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pnldc1B2RXZ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pnldc1B2RXZ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms