Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Spocd1B1ASB6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spocd1B1ASB6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spocd1B1ASB6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spocd1B1ASB6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms