Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3173A6NAS3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm3173A6NAS3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm3173A6NAS3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm3173A6NAS3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 404.8 ms