Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vmn1r232A2RTT5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r232A2RTT5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r232A2RTT5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms