Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbf1A2A870 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbf1A2A870 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbf1A2A870 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbf1A2A870 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbf1A2A870 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Fbf1A2A870 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbf1A2A870 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbf1A2A870 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Fbf1A2A870 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Fbf1A2A870 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Fbf1A2A870 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms