Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VNN3Q9NY84 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms