Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Xab2Q9DCD2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Xab2Q9DCD2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Xab2Q9DCD2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Xab2Q9DCD2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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