Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Stx17Q9D0I4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Stx17Q9D0I4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Stx17Q9D0I4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Stx17Q9D0I4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stx17Q9D0I4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms