Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Ctu1Q99J10 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ctu1Q99J10 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ctu1Q99J10 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Ctu1Q99J10 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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