Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp20Q8C6M1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp20Q8C6M1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms