Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cxcl16Q8BSU2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cxcl16Q8BSU2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Cxcl16Q8BSU2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcl16Q8BSU2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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