Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sec31aQ3UPL0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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