Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFK8

Frmd8, FERM domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd8Q3UFK8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Frmd8Q3UFK8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms