Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC173Q0VFZ6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms