Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rundc1Q0VDN7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms