Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Calb2Q08331 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Calb2Q08331 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms