Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CENPEQ02224 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CENPEQ02224 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms