Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gjb2Q00977 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms