Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTBP2P56545 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTBP2P56545 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms