Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hps1O08983 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hps1O08983 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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