Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP18Q9UMW8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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