Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrbp1Q99J45 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms