Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ulk4Q3V129 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ulk4Q3V129 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms