Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC15Q0P6D6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms