Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RykQ01887 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RykQ01887 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RykQ01887 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RykQ01887 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RykQ01887 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RykQ01887 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RykQ01887 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RykQ01887 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RykQ01887 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RykQ01887 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RykQ01887 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RykQ01887 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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