Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lig3P97386 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lig3P97386 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms