Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cbx1P83917 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cbx1P83917 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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