Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gnb1P62874 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gnb1P62874 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms