Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rab5cP35278 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rab5cP35278 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms