Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mmp13P33435 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mmp13P33435 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp13P33435 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Mmp13P33435 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mmp13P33435 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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