Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Lmod3E9QA62 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms