Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6BQ9NRW1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAB6BQ9NRW1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms