Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSX2Q9BZM3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GSX2Q9BZM3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms