Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BORCS6Q96GS4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms