Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trerf1Q8BXJ2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trerf1Q8BXJ2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trerf1Q8BXJ2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trerf1Q8BXJ2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Trerf1Q8BXJ2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trerf1Q8BXJ2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trerf1Q8BXJ2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trerf1Q8BXJ2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trerf1Q8BXJ2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trerf1Q8BXJ2 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trerf1Q8BXJ2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trerf1Q8BXJ2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trerf1Q8BXJ2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trerf1Q8BXJ2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trerf1Q8BXJ2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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