Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Nphp3Q7TNH6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Nphp3Q7TNH6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms