Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Polr2kQ63871 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms