Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sycp1Q62209 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms