Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnna2Q61301 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnna2Q61301 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms