Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 AC142191.1-201ENSMUST00000219217 699 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Znf48Q3US17 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms