Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rnf180Q3U827 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Rnf180Q3U827 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rnf180Q3U827 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rnf180Q3U827 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rnf180Q3U827 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rnf180Q3U827 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Rnf180Q3U827 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Rnf180Q3U827 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf180Q3U827 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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